13 Gentagne målinger

Eksempel: Calcium uge 10.

13.1 Spaghettiplot: Individuelle profiler

Spaghettiplot laves ved brug af menuen Graph/Chart Builder/Line og valg af ikonet til højre (Multiple Line). Herefter klikkes der på fanen Groups/Point ID og der skal sættes flueben i Columns panel variable, hvorved der kommer et felt i øverste venstre hjørne med navnet Panel?. Sæt nu grp i Panel?, bmd på Y-aksen, visit på X-aksen og girli Set color-boksen (kræver, at girl gøres Nominal - dette gøres i Variable View-vinduet under kolonnen Measure).

NB: I dette plot er det tilsyneladende ikke muligt at markere nogle profiler i andre farver (f.eks. de, som ikke har fuldstændig follow up).

13.2 Figur af gennemsnitskurver

Benyt menuen Graph/Chart Builder/Line og vælg ikonet til højre (Multiple Line). Sæt nu bmd på Y-aksen, visit på X-aksen og grp i Set color-boksen. Ovre i boksen Element Properties til højre i vinduret, vælges under Statistics Mean. Akserne bliver muligvis tossede, da de er afpassede efter selve observationerne, men dette kan afhjælpes som beskrevet i Lenes slides s. 100.

13.3 Mixed Model

Benyt menuen Analyze/Mixed Models/Linear sæt girl over i Subjects og klik Continue. Herefter sættes bmd i Dependent Variable-boksen og såvel grp visit og girl i Factor(s). Under fanen Fixed markeres både grp og visit, der vælges Factorial (defualt) og klikkes Add. Under fanen Random skal vi vælge Build nested terms i Random effects-boksen. Hernæst markeres først girl og der trykkes pil ned. Derefter klikkes Within, man markerer grp, trykker pil ned og klikker Add/Continue. Således at effekten fremstår som girl(grp). Under Statistics afkrydses Parameter estimates.

13.3.1 Prædikterede værdier

Når mixed modellen bygges benyttes også Save-knappen, hvor man under Fixed Predicted Values sætter flueben ved Predicted Values Derved fås en ny variabel i datasættet med navn FIXPRED_1.

Brug herefter sædvanligt Lineplot for variablen FIXPRED_1 vs. visit, med forskellige farver afhængigt af gruppe.

13.3.2 Modelkontrol i mixed model

Ved brug af Save-fanen afkrydes Predicted Values under Fixed Predicted Values . Under Predicted Values & Residuals sættes flueben ved Predicted Values og Residuals (som får navnene hhv PRED_1 og RESID_1). Derved får man de små residualer (=individuelle/betingede).

Store residualer må vi selv danne: Observerede minus prædikterede værdier. Disse danner vi ved hjælp af menuen Transform/Compute, hvor vi i Target Variable skriver det nye variabelnavn, her fixed_resid, og i feltet Numeric Expression sættes: bmd-Fixed Predicted Values (Fixed Predicted Values er FXPRED_1-variablen).

Herefter benyttes menuen Graph/Chart Builder/ til de forskellige figurer (residualplot og QQ-plot).

13.4 Specifikation af CS-struktur

Tager udgangspunkt i model fra kapitel 13.3.

Benyt menuen Analyze/Mixed Models/Linear, sæt girl over i Subjects, visitover i Repeated og skift Repeated Covariance Type til Compound Symmetry. Vælg Continue. Gå herefter ind i fanen Random og sørg for, at der ikke står noget her (fjern evt. girl fra denne). Nu sættes (eller bibeholdes) bmd i Dependent Variable-boksen og såvel grp, visit og girl i Factor(s). I fanen Fixed markeres både grp og visit, der vælges Factorial (defualt) og klikkes Add. Under Statistics afkrydses Parameter estimates og evt. Covariances of residuals.

13.5 Specifikation af kovariansstrukturer

Typen er her Unstructured. Fremgangsmåden/opsætningen er som ovenfor ved specifikation af CS-struktur, men i Repeated skal Repeated Covariance Type nu sættes til Unstructured.

Typen er her AR1. Fremgangsmåden/opsætningen er som ovenfor ved specifikation af CS-struktur, men i Repeated skal Repeated Covariance Type nu sættes til AR(1). Man kan godt have en random effect af girl samtidig med en AR(1)-korrelationsstruktur.

I visse versioner af SPSS kan man også vælge strukturen SP_POWER, som er den autoregressive struktur for irregulære tidspunkter.

13.6 Random regression, med ny tid

Benyt menuen Analyze/Mixed Models/Linear sæt girl over i Subjects og klik Continue. Nu sættes bmd i Dependent Variable-boksen og såvel grp og girl i Factor(s), men years i Covariate(s). I fanen Fixed markeres både grp og years, der vælges Factorial (default) og klikkes Add. I fanen Random sættes girl fra Subjects over i Combinations-boksen nederst i vinduet og years sættes over i Model. Desuden sættes flueben ved Include intercept, og (meget vigtigt): Covariance Type skiftes til Unstructured. Under Statistics afkrydses vi Parameter estimates.