1
Data sæt
1.1
Vitamin D
1.2
Immunoglobulin
1.3
Længdespring
1.4
Slagvolumen, parrede observationer
1.5
Vietnam veteraner
1.6
VCF og blodsukker
1.7
Refe og test
1.8
Lille SundBy
1.9
AMH og P-piller
1.10
Fødselsvægt (Secher)
1.11
Fedme
1.12
Lungefunktion og cystisk fibrose
1.13
Biokemisk iltforbrug (BOC)
1.14
Serum IGF
1.15
RES-systemet i leveren
1.16
Blodtryk og fedme
1.17
Prostatakræft
1.18
Lungecancer
1.19
Calcium tilskud
1.20
Kaniner
2
Illustrationer
2.1
Histogram
2.2
Boxplot
2.3
QQ-plot
2.4
Scatterplot med linjer
2.5
Spaghettiplot
2.6
Bland-Altman plot
2.7
3D-plot
2.8
Bubble plot
3
Deskriptiv statistik
3.1
Mean, median, SD and quantiles
3.2
Fraktiler
3.2.1
Bestemmelse af fraktiler i t-fordelingen
3.3
Tabellering
3.4
Konfidensintervaller
3.4.1
CI for et gennemsnit
3.4.2
CI for en spredning
4
T-test
4.1
One-sample T-test
4.2
Two-sample T-test
4.2.1
T-test
uden
forudsætning om ens varianser
4.2.2
Test for ens varianser
4.2.3
T-test
med
forudsætning om ens varianser
4.2.4
Stikprøveberegning two-sample t-test
5
Lineære modeller
5.1
One-way ANOVA
5.1.1
Test for ens varianser
5.1.2
Tukey korrektion for multiple sammenligninger
5.2
Two-way ANOVA
5.3
Simpel lineær regression
5.4
Kollinearitet
5.5
Variabelselektion
5.6
Modelkontrol
5.6.1
QQ-plot (normalfordeling?)
5.6.2
Residualplot (varianshomogenitet?)
5.6.3
Linearitet
5.7
Diagnostics
5.7.1
Cook’s afstand
5.7.2
Influence
5.8
Prædiktion
5.8.1
Model med én kovariat
5.8.2
Plot af CI og prædiktionsgrænser
5.8.3
Model med flere kovariater
5.9
Kvantificering
5.10
Splines
5.11
Test af flere parametre
5.12
Korrelation
6
Ikke-lineære modeller
7
Ikke-parametriske test
7.1
One-sample tests
7.1.1
Sign test
7.1.2
Wilcoxon signed rank test
7.2
Two-sample tests
7.2.1
Mann-Whitney U / Wilcoxon test
7.2.2
Median test
7.3
Fler-sample tests
7.3.1
Kruskal-Wallis test
7.3.2
Median test
8
Tabelanalyser
8.1
Envejstabeller
8.2
CI for andele / binomialtest
8.2.1
Eksakt CI + test
8.2.2
Asymptotisk CI + test
8.3
Tovejstabeller
8.4
Test for uafhængighed
8.5
Effektmål
8.5.1
Risikodifferens
8.5.2
Relativ risiko og oddsratio
8.6
Power
8.7
Parrede binære data
9
Logistisk regression
9.1
Modelkontrol
9.1.1
Hosmer-Lemeshow Goodness-Of-Fit test
9.1.2
Linearitet - residualer
9.1.3
Cook’s afstand
9.1.4
Influence
9.2
Prædiktion
9.3
ROC-kurver, AUC
9.3.1
Optimale tærskelværdier
10
Overlevelsesanalyse
10.1
Kaplan-Meier kurver
10.1.1
Kumulative incidenser
10.1.2
Kumulerede hazard funktioner
10.1.3
Log-rank test
10.2
Cox proportional hazards model
10.2.1
Test
10.2.2
Modelkontrol: Proportional Hazards
10.2.3
Modelkontrol: Linearitet
10.2.4
Tidsafhængige kovariater
11
Gentagne målinger
12
Korrelerede målinger
12.1
Omstrukturering af data
12.1.1
Bredt til langt format
12.2
Plot af individuelle profiler
12.3
Varianskomponentmodel
12.3.1
Estimation
12.3.2
Modeller med fælles baseline
12.4
Modelkontrol
12.4.1
Små residualer
12.4.2
Store residualer
12.5
Korrelationsstrukturer
12.5.1
Ustruktureret (UN)
12.5.2
Autoregressiv korrelation
12.6
Random regression
12.6.1
Via
lme()
12.6.2
Via `lmer()
13
Samlede scripts
R appendix til slides
11
Gentagne målinger